試験センターが公表している「欠陥の判断基準」・「技能試験の概要と注意すべきポイント」において
ケーブルにマーカーで印をつけることについて特に記載がないため、問題ないと判断しておりますが、
試験センターにお問い合わせいただくことをお勧めいたします。